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马赑
马赑 副教授,研究生导师资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室副教授E-mail(邮件): mbzls@swu.edu.cn教育背景2009-2014 西南大学,生物化学与分子生物学专业,博士2005-2009 湖南理工学院,生物工程专业,本科工作经历2019-至今 西南大学副教授2017-2019 西南大学讲师2015-2017 西南大学博士后研究领域1. 基因组和比较基因组学(基因组组装、重测序、进化、结构变异、全基因组关联分析等);2. 转座子(转座子在植物基因组中...


马赑 副教授,研究生导师

资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室副教授

E-mail(邮件): mbzls@swu.edu.cn

教育背景

2009-2014 西南大学,生物化学与分子生物学专业,博士

2005-2009 湖南理工学院,生物工程专业,本科

工作经历

2019-至今 西南大学副教授

2017-2019 西南大学讲师

2015-2017 西南大学博士后

研究领域

1. 基因组和比较基因组学(基因组组装、重测序、进化、结构变异、全基因组关联分析等);

2. 转座子(转座子在植物基因组中的作用研究);

3. 生物信息学(数据库及生信工具)。

学术贡献

在桑树基因组学的研究中做出突出贡献,先后组装桑树Draft-level、染色体水平及T2T水平参考基因组,搭建桑树转座子数据库(MnTEdb)、桑树天然产物数据库(MMHub)、桑树基因组大小、染色体数目及倍性数据库(MGCPdb)等多个数据库。研究工作推动桑树生物学研究的飞速发展。

代表性论文

1. Wang, H.H., Liu, J.C., Xu, X.F., Li, Y., Yuan, J.L., Zeng, Y.C., Xuan, Y.H., Wang, S., Liu, G., He, N.J.*, Ma, B*. (2024) MGCPdb, a collective resource for mulberry genome size, chromosome number, and ploidy. Forestry Research, 4.

2. Ma, B., Wang, H., Liu, J., Chen, L., Xia, X., Wei, W., Yang, Z., Yuan, J., Luo, Y., He, N. (2023) The gap-free genome of mulberry elucidates the architecture and evolution of polycentric chromosomes. Hortic Res, 10(7): uhad111.

3. Xuan, Y.#, Ma, B.#, Li, D., Tian, Y., Zeng, Q., He, N. (2022) Chromosome restructuring and number change during the evolution of Morus notabilis and Morus alba. Hortic Res, 9: uhab030.

4. Li, D.#, Ma, B.#, Xu, X., Chen, G., Li, T., He, N. (2020) MMHub, a database for the mulberry metabolome. Database-Oxford, 2020: baaa011.

5. Ma, B., Xin, Y., Kuang, L., He, N. (2019) Distribution and Characteristics of Transposable Elements in the Mulberry Genome. Plant Genome, 12(2): 180094.

6. Ma, B., Kuang, L., Xin, Y., He, N. (2019) New Insights into Long Terminal Repeat Retrotransposons in Mulberry Species. Genes, 10(4): 285.

7. Ma, B., Kuang, L.L., Xin, Y.C., Hou, F., He, N.J. (2017) Reverse transcriptase sequences from mulberry LTR retrotransposons: characterization analysis. Open Life Sci, 12(1): 266-276.

8. Ma, B., Li, T., Xiang, Z., He, N. (2015) MnTEdb, a collective resource for mulberry transposable elements. Database-Oxford, 2015(0): bav004.

9. Ma, B., Luo, Y., Jia, L., Qi, X., Zeng, Q., Xiang, Z., He, N. (2014) Genome-wide identification and expression analyses of cytochrome P450 genes in mulberry (Morus notabilis). Journal of integrative plant biology, 56(9): 887-901.